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晶體生長機理和溶劑性質(zhì)、經(jīng)驗總結

嘉峪檢測網(wǎng)        2022-12-08 03:24

在有機合成中,常常有無法僅靠核磁確定結構的化合物,這時即可通過培養(yǎng)單晶進行X-RAY確認結構。利用單晶X射線衍射法確認結構時,最困難的往往是第一步,制備合適的單晶。目前單晶培養(yǎng)主要依賴于經(jīng)驗,單晶是結晶體內(nèi)部的微粒在三維空間呈有規(guī)律地、周期性地排列,或者說晶體的整體在三維方向上由同一空間格子構成,整個晶體中質(zhì)點在空間的排列為長程有序。完整的理解晶體生長機理和溶劑性質(zhì)、經(jīng)驗總結是非常重要的決定因素之一。

 

單晶生長機理是什么?

 

生長機理:單晶生長從溶液中生長最常見,一般經(jīng)歷近飽和—飽和—過飽和—結晶的過程。我們的目標就是要控制好這個過程。這個過程包括晶體的成核與成長。

晶體成核是晶體生長的第一步,晶核質(zhì)量與晶核的多少是晶體生長的關鍵,缺陷晶核將無法得到合格的單晶。晶核成核數(shù)量過多會影響晶體的長大,所以需要控制晶核的質(zhì)量和晶核數(shù)量。

晶體成長是一個非常緩慢的過程,也是晶胞有序排列的過程,時間在晶體成長中對其質(zhì)量起到了關鍵的作用。一般高質(zhì)量有機樣品的單晶生長時間在兩周左右。晶體生長時間過短,晶胞有序排列不好,會降低單晶X射線衍射實驗數(shù)據(jù)分辨率。晶體生長時間過長,增加實驗周期,時效比不佳。

 

什么樣的化合物適合長單晶?

 

晶體生長的難易程度取決于化合物的本性,事先了解什么樣的結構適合長單晶,什么樣的結構難長甚至不可能長出來單晶。

從分子結構考慮:1.擁有剛性結構比如苯環(huán)的化合物比擁有柔性結構的化合物更容易析出單晶;2.烷基鏈超過4個碳的一般難以長出單晶;3.含氯的取代基一般輕易長單晶;

從外觀角度判斷:1.通過旋轉蒸發(fā)或者簡單重結晶所得樣品,肉眼觀察光澤很好,有規(guī)則外形,則容易生長;2.油狀物難長出單晶,可經(jīng)過進一步提純再去培養(yǎng);3.水溶性較油溶性化合物難長。

 

單晶培養(yǎng)方法

 

現(xiàn)在常用的單晶生長方法有溶液緩慢揮發(fā)法、冷卻法、液相擴散法、氣相擴散法。99%的單晶都是用這幾種方法生長出來的。

 

揮發(fā)法

 

晶體生長機理和溶劑性質(zhì)、經(jīng)驗總結

揮發(fā)法:溶劑的不斷揮發(fā),使溶液由不飽和達到飽和過飽和的狀態(tài),從而析出單晶。

 

優(yōu)勢:簡單。

 

缺點:需要大量的材料,在開始接近飽和狀態(tài)時會導致產(chǎn)生很多晶核,不適用于對空氣敏感的化合物。

 

冷卻法

 

晶體生長機理和溶劑性質(zhì)、經(jīng)驗總結

冷卻法:溫度降低溶解度減小,使溶液由不飽和達到飽和過飽和的狀態(tài),從而析出單晶。

 

優(yōu)勢:簡單,特別適合中度溶性的物質(zhì)。

 

缺點:需要大量的材料,通常發(fā)生在高溫下,它可能導致無序或?qū)\生的結晶。

 

液相擴散法

氣相擴散法

 

晶體生長機理和溶劑性質(zhì)、經(jīng)驗總結

液相擴散法、氣相擴散法:不良溶劑緩慢揮發(fā)或通過液-液擴散的方式進入良溶劑改變?nèi)芙舛仁沟镁w析出。

 

優(yōu)點:用量較少,容易控制。

 

缺點:比較難尋找兩個合適的溶劑。

 

單晶培養(yǎng)溶劑體系選擇

 

溶劑極性:了解不同溶劑長出來的晶體可能都會不一樣,這與極性有很大關系,所以單晶培養(yǎng)溶劑的選擇很重要?;衔锓N類不同,溶劑也會非常不一樣。

溶劑對樣品的溶解度適中:溶解度太大或太小都不利于獲得樣品的單晶。

溶劑的揮發(fā)度適中:溶劑的揮發(fā)度太大或太小均不利于單晶的生長。

單一溶劑系統(tǒng):如果樣品能夠找到一種溶解度與揮發(fā)度都適中的溶劑,就可以使用該種溶劑系統(tǒng)進行單晶的培養(yǎng)(生長)。

混合溶劑系統(tǒng):當找不到一種溶劑對樣品具有溶解度與揮發(fā)度均適中的情況時,可以選擇兩種或兩種以上的溶劑,制成對樣品溶解度與揮發(fā)度都適中的溶劑系統(tǒng)來進行單晶體的培養(yǎng)。

 

單晶生長容器選擇

 

透光性良好:便于觀察樣品的單晶生長過程。

溫度傳導性良好:便于過飽和溶液制作與單晶樣品生長過程的溫度控制。

容器底部平整光滑:給晶體生長創(chuàng)造良好的空間環(huán)境。

不易被腐蝕:由于單晶生長需要使用各種有機溶劑,所以選擇的容器必須由不易被腐蝕的材料做成。

容器尺寸大小適宜:根據(jù)單晶生長時選擇的樣品量和溶劑量,選擇容器應保證溶液表面不超過容器1/2的高度。

平底玻璃瓶應該是進行晶體生長的最佳容器選擇。

 

單晶生長注意事項

 

對于水溶性的分子,結晶相對困難很多,一般通過干燥緩慢去除溶劑的方法,或者緩慢降溫,或者在水上加一層難溶的有機溶劑。

對于有機溶劑溶解較好的分子,則通過擴散法實現(xiàn)結晶比較多。

化合物結晶前,一定要保證純度,一般要達到95%以上,當然也有例外。

培養(yǎng)單晶需要一個安靜的環(huán)境,最好放到?jīng)]人碰的地方,一般一兩天看一次即可,看的時候一定要小心翼翼,不要動到瓶子。

單晶長成后,及時倒出母液,留少量密封保存,防止風化,也可通過涂抹凡士林來保護。

養(yǎng)單晶是一個漫長的過程,由于不同的化合物有著不同的性質(zhì),因此最適的溶劑系統(tǒng)與過飽和度也不同,需要大家不斷地去摸索溶劑條件。如果樣品量大,建議將樣品均勻分成多份,同時試驗多個條件,這樣可以大大減少養(yǎng)單晶的時間。

 

參考文獻:

 

1] Growing Quality Crystals. https://chemistry.mit.edu/facilities-and-centers/x-ray-diffraction-facility/growing-quality-crystals/[

 
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來源:新陽唯康Nycrist

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