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長單晶的常見操作方法及技巧

嘉峪檢測網(wǎng)        2023-05-10 10:35

所謂單晶(monocrystal, monocrystalline, single crystal),即結(jié)晶體內(nèi)部的微粒在三維空間呈有規(guī)律地、周期性地排列,或者說晶體的整體在三維方向上由同一空間格子構(gòu)成,整個晶體中質(zhì)點在空間的排列為長程有序。單晶整個晶格是連續(xù)的,具有重要的工業(yè)應(yīng)用。在有機合成中,培養(yǎng)單晶主要是為了通過X-RAY確認(rèn)結(jié)構(gòu)。
 
一、長單晶經(jīng)驗簡單總結(jié):
 
1、低溫緩慢揮發(fā)。一般保持在-20度,用微量真空緩慢抽去溶劑。通常24~48小時里就可以見到結(jié)果,成不成。這個方法需要注意添加液氮和干冰。此方法適于室溫和空氣中不太穩(wěn)定的化合物。
 
2、高溫溶解緩慢降溫。通常采取高沸點的溶劑溶解樣品,然后用鋁薄膜包住整個油浴,停止加熱,令其溫度緩慢下降到室溫,再保持1到2天,讓過飽和的溶液盡量結(jié)晶出來。這個方法需要注意,降溫不能太快,還要注意溶液的濃度。此方法適合于化合物溶解度差異比較大,而且對無水無氧要求的化合物比較合適。
 
3、混和溶劑揮發(fā)。用易揮發(fā)良溶劑溶解樣品,然后小心加入不良溶劑,盡量保持分層狀態(tài),令其自我緩慢擴散。這個方法需要注意溶劑搭配選擇。
 
4、簡單揮發(fā)。也就是用溶劑溶解之后,用septum封住,然后插根細(xì)針頭,令其緩慢揮發(fā)。
 
5、濃縮。樣品溶解于溶劑之后,加一個90度彎管和一個接受瓶。整個體系稍微抽一點點真空,接受瓶用干冰冷卻,令溶劑蒸氣在接受瓶里面緩慢冷凝下來,直到有單晶形成。這個方法需要注意冷凝速度,太快不能得到單晶。
 
6、溶劑擴散。這是上面(3)的變通。加工一底下細(xì)瓶頸的帶teflon stopper的長管。用良溶劑把少量樣品溶解,轉(zhuǎn)入長管,體積大概1~2 mL,加的量剛好在細(xì)瓶頸中間。然后直立長管,在上面加入不良溶劑直到接近上面的出口,堵死。之后,小心令長管直立綁在沒有振動的地方,讓溶劑緩慢相互擴散。此方法適合于少量樣品,無水無氧操作。
 
7、核磁管辦法。這個跟上面的(4)差不多,量少而且需要耐心等待。
 
8、冰箱冷凍。通常比較難于結(jié)晶的樣品,室溫下配成接近飽和溶液之后,放入冰箱,令其緩慢結(jié)晶。
 
總之,長單晶需要耐心和不斷嘗試不同的辦法。同時,還得注意樣品的純度和穩(wěn)定性來決定采取什么方法。
 
二、前人經(jīng)驗的匯總:
 
1、溶劑的選擇與加入方法
 
在單晶的培養(yǎng)過程中,我走了與正常結(jié)晶相反的路子。通常是用適量極性大的溶劑提取你的反應(yīng)物質(zhì),然后再滴加少量的極性小的溶劑,放置結(jié)晶。這樣做的結(jié)果是結(jié)晶很慢,而且是結(jié)晶的收率不高。而我用的方法是背道而行。先用極性小的溶劑提取。根據(jù)你的反應(yīng)物質(zhì)量,加入適量的極性小的溶劑,不能全溶解,就加入適量的極性大的溶劑(注意:切不可多加),如果此時還有少量沒有溶解,A)你可以再加重復(fù)極性小的溶劑,再加極性大的溶劑。直到全溶解;B)也可以微熱溶解(如果你的樣品是熱穩(wěn)定好的話)這樣的做法是非常好結(jié)晶的,不信你試試看,如果你晚上做的這樣的操作,第二天早上你會發(fā)現(xiàn)你的晶體已經(jīng)長出來了。C)微熱還有些沒溶解,就直接過濾。這樣也可以很快結(jié)晶。但是會損失些產(chǎn)物。
 
2、溫度的選擇
 
上面談了溶劑的選擇,和加入順序?,F(xiàn)在我再來說說溫度的選擇。溶劑加入后就要選擇放那里結(jié)晶了。你不能總認(rèn)為溫度越低越好,要想得到好的晶體,溫度的選擇很重要的?。?!首先放在室溫(必須無外界震動)一兩天看看,有無結(jié)晶,如有結(jié)晶說明室溫就能結(jié)出好晶體,無需放之低溫。如果室溫不結(jié)晶,再放如0度。過兩天看看,再不行,-5度,-10度,-15度,-20度,-30度,我想,這些條件大家實驗應(yīng)該不難。如過你一開始放于低溫可能結(jié)晶很快但的不到好的晶體??赡苁嵌嗑В皇菃尉?。長晶體過程千萬不能震動。有條件的單獨一間房間來結(jié)晶最好。
 
低溫結(jié)出的晶體再送測試前要處理,不能拿出來就去測。為什么???大家想啊。。。
 
拿出來到室溫,不是溫度升高了嗎?那晶體就可能融化了(我作過這樣的蠢事),首先你的去掉部分溶劑才行。只留少許即可。對水,氧氣敏感的用惰性氣體如N2,Ar氣保護起來再轉(zhuǎn)移溶劑。轉(zhuǎn)移完再沖N2下關(guān)閉你裝晶體的容器活塞。去測試,這樣就不會化了。
 
3、利用溶劑的揮發(fā)
 
無水無氧要求的金屬配合物這種情況的培養(yǎng)單晶要求有手套箱,在手套箱里(有這樣的條件),你可以用schlenk 瓶、小燒杯、以及核磁管來用作結(jié)晶的工具。容器的口部用封模封好。然后上面用細(xì)針扎幾個小眼用來揮發(fā)溶劑。不幾天你會發(fā)現(xiàn)你的容器內(nèi)壁會生長出晶體來。容器的內(nèi)表面越光滑單晶性越好,否則晶體形狀不好缺陷多就會給后面的收單晶衍射數(shù)據(jù)帶來麻煩,甚至?xí)斐蔁o法解晶體結(jié)構(gòu),那將是非??上У?;要強調(diào)的是用Schlenk及核磁管這兩種容器用來結(jié)晶是最好的。為什么呢??做無水無氧的人知道schlenk是無水無氧操作的專用瓶。它有側(cè)活塞用來開關(guān)瓶與外界的相通。所以操作方面很好。在你獲得很好單晶后你要從手套箱里拿出來啊,如果你用別的容器,可能那些對空氣特別敏感的物質(zhì)就不能夠穩(wěn)定到你測量完晶體結(jié)構(gòu)。同樣很小的核磁管也很好封的。而且它要的量很少。不浪費樣品。如果沒有手套箱的話,可能這個方面就不太適用(對于對水,氧敏感的物質(zhì))。
 
4、利用極性?。ㄈ芙舛刃。┑娜軇?/span>
 
你的反應(yīng)結(jié)束后,用極性大的溶劑提取后。再進行濃縮恰好到有溶質(zhì)析出時為此(此時因減壓濃縮體系內(nèi)的溫度應(yīng)該低于外界)等到溫度升到室溫,拿到手套箱內(nèi),用針筒向上面的溶液面上輕輕的滴加幾滴極性小的(溶解度小的)溶劑。這樣處理完你會很易得到很好的晶體的。此時如果你細(xì)心的話你會發(fā)現(xiàn),你的晶體結(jié)晶時是從液面開始的。為什么???仔細(xì)想。
 
以上是我在培養(yǎng)要求比較苛刻有機金屬配合物單晶常用的方法,一般是幾種方法同時做,不是每種方法都能或總能培養(yǎng)出單晶,更多的是取決于配合物的結(jié)晶性好壞??傊褪嵌嘣嚕翰煌臏囟取⑷軇?、混合溶劑的比例……
 
總之,單晶的培養(yǎng)溶劑的選擇很重要,有些時候你會發(fā)現(xiàn)你選擇的溶劑不同,即使你很溶劑得到晶體,但是晶體的形狀會各不相同的。甚至有些時候你得到的晶體不是規(guī)則的,或是細(xì)長的針狀的,所以溶劑的選擇很重要。我總結(jié)出來,一般我做反應(yīng)時候用極性相對大些的甲苯、乙醚、THF等。再結(jié)晶時候用極性小些正己烷、以及正己烷與甲苯的混合溶劑,或其它的混合溶劑。
 
首先需要強調(diào)的是長單晶是一種藝術(shù),而不完全歸結(jié)于科學(xué),或者說它是一門介于科學(xué)和藝術(shù)之間的技術(shù)。對于水溶性好的分子,結(jié)晶是很困難,一般都是通過干燥緩慢去除溶劑的辦法,也有的通過極緩慢的降溫來獲得單晶,或者在水上加入一層難溶性的有機溶劑。
 
對于在有機溶劑中溶解比較好的分子,他們的結(jié)晶一般都是通過擴散的辦法來實現(xiàn),如將乙醚或是苯擴散進入乙腈中。
 
對于生物大分子單晶,一般都采用懸滴法,即在一個小而密閉的容器中,下邊放溶劑,上邊加一滴分子飽和的溶劑,然后封閉之。
 
要結(jié)晶的分子一般來講一定要純,達到95%以上的純度,當(dāng)然也不絕對,也有的體系在較低純度就拿到了單晶,比如饒子和院士發(fā)在CELL上的蛋白晶體結(jié)構(gòu)就是從一個混合體系中拿到的。
 
三、單晶培養(yǎng)技巧
 
1.單晶培養(yǎng)的方法多種多樣,我們沒必要把握那些難以操作的,如升華法、共結(jié)晶法等。最簡單的最實用。常用的有1.溶劑緩慢揮發(fā)法;2.液相擴散法;3.氣相擴散法。99%的單晶是用以上三種方法培養(yǎng)出來的。
 
2.單晶培養(yǎng)所需樣品用量
一般以10-25mg為佳,假如你只有2mg左右樣品,也沒關(guān)系,但這時就要選擇液相擴散法和氣相擴散法,不能使用溶劑緩慢揮發(fā)法。
 
3.單晶培養(yǎng)的樣品的預(yù)處理
樣品溶解后一定要過濾,不能用濾紙,而是用一小團棉花輕輕的塞在滴管的中下部或下部,不要塞太緊,否則流的太慢。樣品當(dāng)然是越純越好,不過假如實在沒辦法弄純也沒關(guān)系,培養(yǎng)一次就相當(dāng)于提純了一次,我經(jīng)常用一些TLC顯示有雜點的東西長單晶,但得多養(yǎng)幾次。
 
4.一定要做好記錄
一次就得到單晶的可能性比較小。因此最好的方法就是在第一次培養(yǎng)單晶的時候,采取少量多溶劑體系的辦法。假如你有50mg樣品,建議你以5mg為一單位,這樣你可以同時實驗10種溶劑體系,而不是選兩種溶劑體系,每個體系25mg。這是做好記錄就非凡重要,以免下次又采用已經(jīng)失敗的溶劑體系,而且單晶解析時必須知道所用的溶劑。
 
5.培養(yǎng)單晶時,最好放到?jīng)]人碰的地方,這點大家都知道。我想說的是你不能一天去看幾次也不能放在那里5,6天不管。也許有的溶劑體系一天就析出了晶體,結(jié)果5天后,溶劑全干了。一般一天看一次合適,看的時候不要動它。明顯不行的體系
(如析出絮狀固體)就要重新用別的溶劑體系再重新培養(yǎng)。
 
6.液相擴散法中良溶劑與不良溶劑的比例最好為1:2-1:4。
 
7.烷基鏈超過4個碳的很難培養(yǎng)單晶。
 
8.分子中最好不要有叔丁基,因為輕易無序,影響單晶解析的質(zhì)量。
 
9.含氯的取代基一般更易長單晶,如4-氯苯基取代化合物比苯基取代化合物更易長單晶。
 
10.單晶培養(yǎng)-無水無氧條件下的單晶培養(yǎng),麻煩的方法我就不說了,最簡單的方法就是將你的固體樣品加入一帶橡皮塞的容器(最常用的就是核磁管,塞子不是我們常用的硬塞子,而是軟的橡皮塞(隨便什么塞子都行,只要能密封且能扎針頭),先抽真空,然后通氮氣,再用注射器加入良性溶劑,充分溶解(超聲),然后再用注射器沿器壁加入不良溶劑即可。
 
你將會發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)單晶不僅需要耐心,而且還需要一雙靈巧的雙手。結(jié)晶過程對溫度和其它輕微的擾動都非常敏感。因此,你應(yīng)該在相似的條件下多嘗試幾個不同的實驗溫度,并為單晶的生長尋找一個沒有干擾的安靜環(huán)境。這里有一些經(jīng)驗性的貼士供你參考,以利于你的實驗開展。
 
方案#1
 
有時好的單晶僅需冷卻溶液即可生長。你也可以嘗試加熱溶液至所有物質(zhì)完全溶解,達到過飽和,再慢慢地使其冷卻。
 
方案#2
 
1)選取一種可以溶解你的目標(biāo)化合物的溶劑,制成飽和溶液。
 
2)如果有必要,可以通過過濾除去其中的不溶性雜質(zhì)。對于少量溶液,可使用一種有效的過濾器,其制備方法是:將玻璃毛(甚至可以用面巾紙)塞入一根一次性Pasture滴管中,然后填入一英寸左右助濾物(如硅藻土Celite)。用新鮮溶劑濕潤硅藻土,然后用球形壓力器將溶液壓過該管進行過濾。
 
3)尋找另一種溶劑,使目標(biāo)化合物在其中不溶解(或僅微量溶解),而且這種溶劑能夠和前一種溶劑混溶,并具有較低的密度。
 
4)將第二種溶劑小心地鋪在小瓶中飽和溶液的上面。在兩相界面上可看到一些混濁物。單晶將會沿著這個界面生長。
 
方案#3
 
將盛有飽和溶液的小瓶放置在另外一個較大的瓶中。在外面的大瓶中加入第二種溶劑并且蓋緊蓋子。第二種溶劑將會慢慢地擴散到飽和溶液中,晶體就會出現(xiàn)了!為了進一步減慢這個過程,可將這個擴散裝置放在冰箱中。
 
常用的溶劑系統(tǒng):
 
CH2Cl2/乙醚或戊烷 
 
THF/乙醚或戊烷
 
甲苯/乙醚或戊烷 
 
水/甲醇
 
CHCl3/正庚烷
 

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