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嘉峪檢測(cè)網(wǎng) 2024-09-25 08:27
一、 寫在前面
Western Blotting(WB)作為常見的蛋白檢測(cè)手段之一,通常是絕大部分科研工作者不可避免的一項(xiàng)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)。然而,其實(shí)驗(yàn)流程相對(duì)較為復(fù)雜,忽視任一細(xì)節(jié)均有可能導(dǎo)致整個(gè)實(shí)驗(yàn)的失敗,這也常令很多科研者苦不堪言。目的條帶不清晰而背景卻又黑又臟,甚至顯影出來只能看見黑乎乎的背景,這是WB中最為常見的問題之一,是什么原因?qū)е铝烁弑尘暗某霈F(xiàn)?面對(duì)這種情況我們?cè)撊绾谓鉀Q呢?本文就從以下幾個(gè)方面進(jìn)行詳細(xì)地介紹。

二、 常見的背景來源及解決方案
1.樣品質(zhì)量
樣品質(zhì)量是決定WB成敗的關(guān)鍵一步,絕大多數(shù)情況下我們均是以提取總蛋白作為WB的開端。而在總蛋白提取過程中不可避免會(huì)受到諸如核酸、脂類、裂解液等物質(zhì)的干擾,樣品純度受到影響自然而然會(huì)帶來高背景。此外,在我們目的蛋白表達(dá)量較低的情況下,其在總蛋白中的比例也相應(yīng)較低,不易檢測(cè)到,為優(yōu)化目的條帶,不得不做出提高抗體濃度、加大上樣量等措施,由此造成高背景。
因此,在提取總蛋白時(shí),一方面我們需要保證盡可能地提高樣品純度,如:吸取蛋白時(shí)需小心謹(jǐn)慎,避免吸入雜質(zhì);另一方面則要防止蛋白降解造成蛋白丟失,如:提取過程均在低溫環(huán)境中進(jìn)行、加入蛋白酶抑制劑防止蛋白降解等。
2.上樣量
上樣量對(duì)背景也有影響。如果預(yù)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)蛋白濃度較低,那么下次提取時(shí)就需要適當(dāng)提高組織或細(xì)胞用量,而不可一味地加大上樣量,如下圖所示,加大上樣量時(shí),背景也會(huì)隨之加深。

3.封閉
封閉的目的在于去除其他無關(guān)蛋白的影響,倘若封閉不完全,就會(huì)產(chǎn)生高背景。這通常也是產(chǎn)生高背景時(shí)需要優(yōu)先考慮并進(jìn)行優(yōu)化的因素,一方面可以提高封閉液的濃度,另一方面亦可延長封閉時(shí)間,以降低背景。
4.洗滌
洗滌不徹底也會(huì)導(dǎo)致一些非特異性結(jié)合的殘留,從而產(chǎn)生高背景。因此,可以通過加大洗滌液的用量、增加洗滌次數(shù)、延長洗滌時(shí)間來改善。
5.膜
一方面,需要確保我們所采用的NC膜或PVDF膜保存得當(dāng),是干凈無污的,以免膜本身的原因影響顯影造成高背景;另一方面,在整個(gè)操作過程中要充分確保膜的濕潤,謹(jǐn)防干膜帶來高背景。
6.抗體
抗體濃度過高時(shí)也會(huì)導(dǎo)致高背景,甚至條帶反白,因此,需通過預(yù)實(shí)驗(yàn)摸索抗體濃度及孵育時(shí)間,尋求合適的抗體孵育條件。另外,抗體本身的質(zhì)量也是造成高背景的關(guān)鍵,抗體質(zhì)量有問題,要么直接無條帶,要么產(chǎn)生過多雜帶造成高背景,此時(shí)就需要考慮換抗體,當(dāng)然,由于抗體售后過于繁瑣,更換抗體也會(huì)增加實(shí)驗(yàn)成本,耽誤實(shí)驗(yàn)進(jìn)度等問題,因此,更換抗體也是我們毫無束手之策時(shí)才需要考慮的。

三、 其他實(shí)用小Tips
1.洗滌時(shí),無論采用PBST還是TBST,Tween-20均在其中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,其能有效去除非特異性結(jié)合產(chǎn)物,降低背景,可以將其通俗的理解為去污劑,倘若背景較深時(shí),可以適當(dāng)加大PBST或TBST中Tween-20的用量,以有效去除背景;
2.顯影后倘若發(fā)現(xiàn)背景較深,可再次進(jìn)行封閉然后重新孵育抗體;
3.背景較深時(shí),亦可將條帶置于洗滌液中放在4℃冰箱保存過夜,浸泡一晚甚至更長時(shí)間后再去顯影,可以有效降低背景,但需以不影響目的帶為宜。

來源:實(shí)驗(yàn)老司機(jī)