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彗星電泳實驗的操作步驟及經驗分享

嘉峪檢測網        2024-09-27 08:21

彗星電泳實驗,又稱為單細胞凝膠電泳試驗(Single Cell Gel Electrophoresis,SCGE),是一種用于檢測DNA損傷的實驗技術,可在單個細胞水平上進行。這種方法能夠有效評估DNA損傷的程度,包括由受試物直接引起的DNA鏈斷裂、堿性不穩(wěn)定性位點導致的DNA鏈斷裂,以及DNA切割修復過程中引起的瞬時DNA鏈斷裂,是一種常用的DNA損傷評估方法。

 

實驗原理:

 

彗星電泳實驗基于凝膠電泳技術,通過在電場中將DNA或其他生物分子移動到凝膠中,利用分子大小和電荷差異產生的不同遷移速度分離這些分子。樣品加載到凝膠中后,在電場作用下,帶負電荷的分子會向陽極移動,而帶正電荷的分子則向陰極移動,形成不同長度的帶狀圖案。這些帶狀圖案中,尾部呈現延伸狀,類似彗星,故得名彗星電泳。通過觀察這些帶狀圖案,可以評估DNA損傷與修復、細胞凋亡等生物學過程,是一項重要的生物分析技術。

 

實驗步驟:

 

1、準備細胞:將細胞鋪于六孔板中,待其生長到80%-90%的密度,收集細胞并進行計數,然后使用PBS緩沖液將其稀釋至每毫升含有100個細胞。

2、玻片(載玻片)制備:使用PBS緩沖液分別制備20毫升含有0.5%正常熔點瓊脂糖(NMPA)和0.5%低熔點瓊脂糖(LMPA)的溶液。

3、第一層膠制備:將載玻片浸入煮沸的正常熔點瓊脂糖溶液中,可使用小燒杯。將其取出后,擦拭去背面的瓊脂糖,然后放入60攝氏度烤箱中過夜,隨后在室溫下保存。

4、第二層膠制備:將準備好的0.5%低熔點瓊脂糖溶液放入37攝氏度的水浴鍋中備用。取100微升該溶液,并加入10微升細胞懸液(約含有1000個細胞)。充分混合后,滴在第一層膠上,并蓋上新的載玻片,用力壓平。將其放置在4攝氏度下1-3分鐘以固化。需注意,固化時間過長會導致膠變干,使得蓋玻片與膠結合緊密,難以取下蓋玻片,同時易造成膠一同被扯下。

5、裂解細胞:將玻片緩慢浸入新鮮配制的冰冷細胞裂解液中,保持在4攝氏度條件下裂解2小時。

6、堿化處理及電泳:將玻片取出,置于水平電泳槽中(正極端),并排放置,確保無空隙。倒入新鮮配制的冰冷電泳緩沖應用液,使其高出膠面2毫米,避免氣泡存在。放置10至30分鐘,通常選用15分鐘,以使DNA解鏈。設定電壓為25V,電流為300mA,進行20分鐘的電泳。

7、中和:切斷電源,取出玻片并置于染缸中,用中和緩沖液(Tris-HCl)浸洗,每次5分鐘,共重復3次。

8、染色:在中和后,將玻片晾干至中性狀態(tài)。然后使用20ul至50μl的PI應用液進行染色,并蓋上新的蓋玻片。除了中和和染色步驟外,其余各步應在暗處進行,以避免額外的DNA損傷。

9、鏡檢:染色后的DNA樣品應盡快在熒光顯微鏡下進行觀察。未受損的細胞表現為圓形熒光核心,即彗星頭部,沒有尾巴。而受損的細胞則呈現出彗尾朝向陽極的形態(tài),形成明亮的頭部和尾部。

 

注意事項:

 

(1)第7步如果不立即觀察,可以在中和后不染色,將玻片放入無水乙醇的染缸中浸泡15分鐘,然后撈出晾干并避光保存,需要時再染色。這樣處理后的玻片可保存三個月。但如果需要進行脫水處理,則應選擇透明底的玻片,因為磨砂玻片表面不平整,在酒精脫水后凝膠會形成顆粒,影響讀片質量。

 

(2)在制備凝膠時,必須防止脫膠現象的發(fā)生,為脫膠會導致凝膠結構的破壞,進而影響其完整性和穩(wěn)定性,從而影響實驗結果的準確性和可重復性。

 

(3)如果 DNA 損傷嚴重,則產生的碎片就越多、越小,向陽極遷移的DNA碎片量就越多,遷移距離也越長,熒光染色后就能看見“彗星”樣尾長并且熒光強度增強。未受損傷的 DNA 大分子則由于細胞膜的阻隔,滯留在原處。

 

如圖所示為M059K細胞彗星結果:

 

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來源:實驗老司機

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