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嘉峪檢測(cè)網(wǎng) 2024-12-05 09:04
SDS-PAGE電泳是蛋白質(zhì)分離純化中最常用的技術(shù)之一,但實(shí)驗(yàn)過程中,我們常常會(huì)遇到各種各樣的問題。下面總結(jié)了一些常見的SDS-PAGE電泳問題以及相應(yīng)的解決方法,希望對(duì)你有幫助!
在了解相關(guān)問題之前,我們首先要搞清楚SDS-PAGE電泳是怎么工作的?
想象一下,我們有一堆不同大小的豆子,想把它們按照大小排隊(duì)。而SDS-PAGE電泳就是蛋白質(zhì)的“篩子”,它能把不同大小的蛋白質(zhì)按照“身高”(分子量)排成一隊(duì)。
SDS
SDS是一種特殊的化學(xué)試劑,它可以包裹住蛋白質(zhì),讓所有的蛋白質(zhì)都帶上負(fù)電荷。這樣,在電場(chǎng)的作用下,所有的蛋白質(zhì)都能夠向正極移動(dòng)。
凝膠
凝膠就像一個(gè)布滿小孔的海綿,不同的孔大小不一,作用類似于蛋白質(zhì)的“跑道” 。蛋白質(zhì)在電場(chǎng)的作用下,就像參加比賽一樣,從凝膠的一端往另一端跑。大的蛋白質(zhì)跑得慢,小的蛋白質(zhì)跑得快。最后,它們就會(huì)按照大小排成一個(gè)梯度。

(圖片來源:https://gyansanchay.csjmu.ac.in/wp-content/uploads/2022/10/SDS-PAGE.pdf)
常見問題及解答
1、分離膠濃度的選擇
在SDS-PAGE電泳中,分離膠濃度是一個(gè)至關(guān)重要的參數(shù),直接影響著蛋白質(zhì)的分離效果。濃度越高,孔徑越小,越適合分離小分子蛋白質(zhì);濃度越低,孔徑越大,越適合分離大分子蛋白質(zhì)。以下是我們總結(jié)的一個(gè)常見凝膠溶液濃度與蛋白質(zhì)分子量范圍的對(duì)應(yīng)關(guān)系表:(僅供參考)

2、凝膠凝結(jié)的太慢或不凝固
SDS-PAGE凝膠的凝固時(shí)間一般在30分鐘~1小時(shí)之間。如果凝固速度過慢,很可能是因?yàn)橐l(fā)聚合反應(yīng)的兩種試劑——TEMED和APS出了問題。TEMED和APS的用量不足或者失效都會(huì)導(dǎo)致凝膠凝固緩慢。
其中,APS(過硫酸銨)非常不穩(wěn)定,容易分解失效,所以每次使用前都需要現(xiàn)配。而TEMED也比較敏感,容易被氧化變黃,失去活性。
解決方法:
檢查并調(diào)整引發(fā)劑用量,確保TEMED和APS用量準(zhǔn)確,并按比例混合。
保證APS現(xiàn)配現(xiàn)用,避免長(zhǎng)時(shí)間暴露在空氣中。
TEMED要注意避光保存,并置于4℃冰箱中。
3、條帶拖尾和彌散

可能的原因:
樣品降解:蛋白質(zhì)在制備過程中發(fā)生降解,導(dǎo)致分子量變小,條帶彌散。
樣品過載:上樣量過多,導(dǎo)致條帶重疊,分辨率降低。
樣品緩沖液配制錯(cuò)誤:緩沖液的pH值或離子強(qiáng)度不合適,影響蛋白質(zhì)的遷移。
樣品溶解不充分:蛋白質(zhì)沒有完全溶解,導(dǎo)致部分蛋白質(zhì)沒有進(jìn)入凝膠。
解決方案:
延長(zhǎng)變性時(shí)間:確保蛋白質(zhì)充分變性,一般在95-100℃加熱5~10分鐘。
減少上樣量:逐步減少上樣量,直到條帶清晰為止。
更換緩沖液:如果緩沖液使用時(shí)間過長(zhǎng),需要更換新鮮的緩沖液。
4、“微笑”型條帶(條帶兩邊翹起,中間凹下)

這種現(xiàn)象通??赡苁怯捎谝韵聨讉€(gè)原因造成,需要逐一排查。
凝膠凝固不均勻
在較厚的凝膠中,凝膠的中間部分凝固的不均勻。建議待凝膠充分凝固后再進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
電流過大
電流過大可能導(dǎo)致凝膠局部過熱,從而引起條帶彎曲??梢赃m當(dāng)降低電泳電壓,減少電流,或使用恒流電源,確保電流穩(wěn)定。
電泳時(shí)間過長(zhǎng)
電泳時(shí)間過長(zhǎng)也可能導(dǎo)致凝膠過熱,引起條帶彎曲??梢赃m當(dāng)縮短電泳時(shí)間,并觀察溴酚藍(lán)指示劑的位置,當(dāng)其到達(dá)凝膠底部時(shí)停止電泳。
玻璃板未夾緊
檢查玻璃板之間的密封性,確保沒有漏液現(xiàn)象。
上樣不均勻
樣品在上樣時(shí)分布不均,也可能導(dǎo)致條帶彎曲。建議使用微量移液器緩慢、均勻地將樣品加入樣品孔中。
5、“皺眉”型條帶(條帶兩邊向下,中間鼓起)

出現(xiàn)這種現(xiàn)象通??赡苁怯捎谝韵聨讉€(gè)原因造成:
樣品不均一或上樣量過多:
樣品中含有不溶性顆?;蚋邼舛塞},導(dǎo)致樣品在孔中沉淀,影響電泳遷移。上樣量過大導(dǎo)致樣品孔中的蛋白質(zhì)濃度過高,中間部分的蛋白質(zhì)遷移受到阻礙。建議充分溶解樣品,去除不溶性物質(zhì),控制上樣量,避免過載。
電泳條件不穩(wěn)定:
電壓波動(dòng)、電流不穩(wěn)定等因素都會(huì)影響蛋白質(zhì)的遷移。
玻璃板:
玻璃板上有殘留的雜質(zhì),影響了樣品的遷移。也有可能是兩塊玻璃板之間的底部間隙氣泡沒有排盡,阻礙電場(chǎng)均勻分布,影響樣品遷移。

來源:實(shí)驗(yàn)老司機(jī)