您當前的位置:檢測資訊 > 實驗管理
嘉峪檢測網(wǎng) 2024-12-30 08:47

圖片來源:https://www.technologynetworks.com/proteomics/articles/an-introduction-to-post-translational-modifications-343603
翻譯后修飾(Post-translational modifications, PTMs)由于通常是通過在蛋白分子上增加一個基團達成修飾,對分子本身有物理改變,很可能對WB實驗結(jié)果有所影響。由于翻譯后修飾形式多種多樣,對條帶影響的具體表現(xiàn)包括但不限于以下所舉例子:
1. 分子量變化:磷酸化、糖基化、泛素化、泛素化等眾多翻譯后修飾形式會改變目標蛋白的分子量,可能導致靶標蛋白實際檢測分子量大小出現(xiàn)偏差,蛋白樣品在凝膠上的遷移位置與未修飾蛋白相比發(fā)生偏移,出現(xiàn)更高或更低的分子量帶。
2. 構(gòu)象變化:由于其空間結(jié)構(gòu)發(fā)生一定改變,將可能影響抗體與表位的結(jié)合,從而減少信號或引起非特異性結(jié)合。
3. 電荷變化:如乙?;?、磷酸化等修飾可以改變蛋白的整體電荷,可能影響電泳過程中的蛋白遷移速率等方面。
4. 溶解性和穩(wěn)定性:翻譯后修飾可能影響蛋白的溶解性和穩(wěn)定性,可能會影響蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上的效率或者影響蛋白在膜上的保留??梢栽谙卤碇幸桓Q潛在影響:

表1:各種翻譯后修飾對蛋白溶解性與穩(wěn)定性的影響及其機理
● 以下我們將結(jié)合具體蛋白舉一些實例:
1. ENOS蛋白經(jīng)過肉豆蔻?;⒆貦磅;蛄姿峄刃揎椇?,實際檢測分子量增大,會出現(xiàn)條帶大小增大和多帶現(xiàn)象。
2. Nrf2蛋白存在多種翻譯后修飾(如乙?;⑻腔?、磷酸化和泛素化),導致實際檢測分子量大小在100kD左右,遠大于其預測大小68kD。此外,由于該蛋白易被降解,樣本處理時加入抑制蛋白酶體的藥物如MG132可以獲得更多信號。同時,其檢測結(jié)果可能出現(xiàn)多帶現(xiàn)象,主要由多種修飾形式和降解產(chǎn)物造成。
3. CD31蛋白因其存在多個糖基化修飾位點和磷酸化修飾,導致實際檢測時條帶大小可達125kD,比預測大小大四十多個kD。因此,在檢測這類蛋白時要避免膜的移動,保留全部膜,完整觀察膜上的所有條帶,以準確確定蛋白定位;還應另外設置陽性對照組。
4. Mannose receptor蛋白由于糖基化修飾導致實際檢測分子量大小變?yōu)?00kD左右,而非預測的166kD,反映其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的復雜性;且作為多次跨膜蛋白,樣品制備時不應煮樣,避免蛋白聚集,產(chǎn)生影響蛋白遷移的非特異性結(jié)合或聚合物,進而導致檢測困難或信號弱。
5. 如COX 2蛋白的相關(guān)實驗表明,糖基化修飾也可能造成條帶模糊不清的現(xiàn)象;CD63蛋白具有多糖基化修飾的特點,導致實際檢測到的條帶大小范圍極其廣泛,很可能檢測到的條帶全都出現(xiàn)彌散現(xiàn)象;PD-L1等存在糖基化修飾的腫瘤相關(guān)蛋白,在檢測時也可能出現(xiàn)條帶彌散的現(xiàn)象;這一現(xiàn)象究其根本原因,在于多重糖基化修飾位點的活動不會完全一致,因此帶來多種不同的修飾后蛋白,導致其實際分子量形成一個連貫譜系,表現(xiàn)在條帶上則是廣泛彌散的條帶。
6. 大量的翻譯后修飾導致蛋白存在多種形式,表現(xiàn)在電泳結(jié)果中即是多個條帶。如骨橋蛋白Osteopontin由于存在糖基化、磷酸化等多種翻譯后修飾,在實際實驗中可能檢測到多條蛋白條帶,且大小與預測值32kD嚴重不符;內(nèi)源性c-Myc蛋白在發(fā)育后可能經(jīng)歷修飾,導致其出現(xiàn)多帶條帶,甚至可能有時實驗結(jié)果無信號。
7. 多次跨膜蛋白在高溫下易發(fā)生聚集,如果在制備樣品時煮樣,可能導致后期檢測無信號;抗體的免疫原序列為CXCRF的C端序列如同時存在磷酸化形式,也可能會干擾抗體與蛋白的結(jié)合,導致無信號現(xiàn)象;還有可能是由于蛋白的后修飾導致其分子量變大,實際檢測的條帶位于55或60kD以上,但所使用的抗體識別的范圍卻只覆蓋到50kD以下,因此出現(xiàn)無信號的結(jié)果。


來源:實驗老司機