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嘉峪檢測(cè)網(wǎng) 2025-01-02 08:44
DNA凝膠回收即從瓊脂糖凝膠中提取DNA的過(guò)程,大致經(jīng)過(guò)切膠、溶解、離心分離等步驟,常規(guī)回收過(guò)程一般使用試劑盒實(shí)現(xiàn),其常見問(wèn)題及注意事項(xiàng)如下:
1.對(duì)于需要回收的DNA,跑膠時(shí)應(yīng)選擇梳齒寬、薄的梳子,同時(shí)保證上樣量充足。
2.切膠過(guò)程中,若不確定條帶具體位置,可在紫外照射下進(jìn)行,快速切膠,防止紫外照射時(shí)間過(guò)久導(dǎo)致DNA變性。同時(shí),切膠的刀片保持干凈,防止污染,切膠時(shí)盡量只切有條帶的膠,減小切膠體積,但務(wù)必保證將條帶膠全部切下,將切下的膠塊切小后全部收集到離心管內(nèi)。
3.加入溶解液溶膠時(shí),在55℃-65℃的水?。ň唧w溫度由說(shuō)明書決定)中進(jìn)行,同時(shí)2-3min震蕩混勻一次,保證瓊脂糖凝膠充分溶解,否則易導(dǎo)致回收效率過(guò)低,正常全部溶解后溶液呈淡黃色。
4.過(guò)柱過(guò)程中保持柱子和回收管干凈,每一步充分離心,同時(shí)保證每一步加入正確的試劑。
5.洗脫液提前在55℃-65℃水浴中溫浴。
6.加入洗脫液前,將柱子開蓋,室溫晾5-10min左右,最大程度上將酒精揮發(fā)干凈,酒精污染也是后續(xù)影響A260/A230比值的重要因素。
7.加入洗脫液體積不宜太多,以30-50μl為宜,洗脫液太多會(huì)造成回收濃度過(guò)低,洗脫液量太少則不宜洗脫,加入洗脫液時(shí)快速垂直滴到膜中央。加入后需靜置一定長(zhǎng)的時(shí)間,充分洗脫。同時(shí),洗脫液最后也可用實(shí)驗(yàn)用的超純水,但需保證PH值在7.0-8.5之間。
8.測(cè)濃度時(shí),重點(diǎn)關(guān)注A260/A280的比值,以1.8-2為宜。若回收成功無(wú)污染,A260/A230比值一般在1.8以上。
9.凝膠回收試劑盒中,部分試劑需加入無(wú)水乙醇后再使用,同時(shí)注意試劑需在有效期內(nèi)。
在實(shí)際膠回收的過(guò)程中,按說(shuō)明書常規(guī)操作也會(huì)出現(xiàn)回收效率低、回收產(chǎn)物污染等情況,以我做實(shí)驗(yàn)為例,在回收過(guò)程中均按說(shuō)明書操作,測(cè)濃度時(shí)比值較低,如下圖所示:

在經(jīng)過(guò)重復(fù)實(shí)驗(yàn)比值仍未提高的基礎(chǔ)上,我們繼續(xù)往下做了后續(xù)的實(shí)驗(yàn),對(duì)后續(xù)的實(shí)驗(yàn)影響不太明顯。同時(shí),為提高A260/A230的比值,我們?cè)诨厥战Y(jié)束后繼續(xù)做了純化,也由試劑盒完成,純化后DNA濃度會(huì)比純化前更低,但比值正常,因此在實(shí)際DNA凝膠回收的過(guò)程中,可根據(jù)回收前的DNA濃度選擇是否進(jìn)行二次純化。

來(lái)源:實(shí)驗(yàn)老司機(jī)