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小分子蛋白如何跑WB?

嘉峪檢測(cè)網(wǎng)        2025-01-22 09:29

在日常實(shí)驗(yàn)過程中,小分子蛋白是非常常見的,常見的凋亡蛋白如Bcl2、Caspase-3、Bax,自噬相關(guān)蛋白如LC3B等均為小分子蛋白,接下來將從以下幾個(gè)方面分享小分子蛋白跑Wb時(shí)的注意事項(xiàng):

 

1. 配膠:整體配膠遵循蛋白分子量越小膠濃度越大的原則,對(duì)于小分子蛋白來說,分離膠濃度一般為12%-15%,對(duì)于小分子蛋白條帶可以分的更加清晰。同時(shí)在倒膠時(shí)濃縮膠的比例可以適當(dāng)增加到4:6,使其充分濃縮,后續(xù)電泳過程中一定程度上可以減少?gòu)浬ⅰ?/span>

 

2. 上樣:根據(jù)日常上樣經(jīng)驗(yàn),建議在跑小分子蛋白時(shí)增加1倍上樣量,防止蛋白彌散過多。選擇marker時(shí),選擇適用于小分子蛋白的marker,后續(xù)敷抗體時(shí)可以更清楚的進(jìn)行裁膜。電泳開始前可用1´loadingbuffer補(bǔ)齊未點(diǎn)樣的膠孔,防止兩邊不齊跑成“八”字。

 

圖1:賽默飛marker示意圖

(左:常規(guī)蛋白marker;右:小分子蛋白marker)

 

3. 電泳:濃縮膠部分設(shè)置恒壓70V、30min左右,一般即可濃縮到一條線上之后調(diào)大電壓至110V,至所需蛋白區(qū)域全部分開為止。盡量避免長(zhǎng)時(shí)間低電壓跑膠,易導(dǎo)致蛋白彌散過多。同時(shí)整個(gè)電泳過程中注意降溫。

 

4. 轉(zhuǎn)膜:由于小分子蛋白分子量小,吸附能力弱,因此轉(zhuǎn)膜時(shí)選擇0.22μm的PVDF膜,常規(guī)0.45μm膜容易穿透,剩余條件同正常蛋白一般可以滿足條件。

 

5. 封閉:快速封閉液或脫脂牛奶按正常條件封閉即可。裁膜時(shí)根據(jù)marker上下留出足夠多的空間。

 

6. 一抗孵育:在保證上述條件的基礎(chǔ)上,一抗是出好結(jié)果的關(guān)鍵一步,若沒前期實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),一抗的稀釋比一般按照說明書配置,若有前期實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn),可適當(dāng)進(jìn)行比例調(diào)整,一抗?jié)舛冗^高最后顯影階段易出現(xiàn)雜帶,過低則可能看不到條帶。使用1´TBST緩沖液稀釋,4℃孵育過夜。

 

7. 后續(xù)二抗比例及孵育時(shí)間、顯影按常規(guī)操作即可。需要注意若抗體不好用或者蛋白難出結(jié)果,在敷完一二抗時(shí)可適當(dāng)延長(zhǎng)洗膜時(shí)間及次數(shù)。

 

注意事項(xiàng):

 

1. 轉(zhuǎn)膜時(shí),若蛋白分子量過小,可適當(dāng)提高甲醇比例(30%左右)改善吸附能力。

 

2. 跑小分子蛋白時(shí)marker盡量不跑到一張膜上,對(duì)于常見內(nèi)參GAPDH、Actin及Tubulin等來說,分離膠濃度大上述蛋白區(qū)域一般分不開或分離不完整,易導(dǎo)致內(nèi)參不齊。

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來源:實(shí)驗(yàn)老司機(jī)

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