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CAR-T細胞治療藥物的生產(chǎn)制備和表征方法

嘉峪檢測網(wǎng)        2025-07-17 09:07

在過去的幾十年中,基于嵌合抗原受體(CAR)T細胞的細胞療法徹底改變了癌癥的治療方式,尤其是血液系統(tǒng)疾病。CAR-T細胞是經(jīng)過基因工程改造的T淋巴細胞,能夠識別特定抗原,其結(jié)構(gòu)由四個部分組成。第一部分是外部結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域負責與靶抗原結(jié)合,決定了CAR-T的親和力和特異性。它通常由單鏈可變片段(scFv)組成。第二部分是鉸鏈區(qū),通常由IgG1或IgG4的鉸鏈-CH2-CH3Fc結(jié)構(gòu)域,或CD4、CD8、CD3ζ或CD28的部分組成。鉸鏈區(qū)對于CAR-T細胞激活,并攻擊腫瘤靶細胞至關(guān)重要。它還連接scFv與CAR結(jié)構(gòu)的第三部分——跨膜區(qū)??缒^(qū)調(diào)節(jié)CAR信號傳導,并控制CAR在T細胞表面的表達。CAR結(jié)構(gòu)的最后一個部分是細胞內(nèi)信號傳導區(qū),其組成在不同代CAR-T細胞中有所不同,但所有CAR-T細胞中均包含CD3ζ信號傳導區(qū)。

 

CAR技術(shù)的優(yōu)勢在于其對靶抗原的特異性和對腫瘤細胞的強大細胞毒性。隨著CAR-T細胞的發(fā)展,細胞內(nèi)信號傳導區(qū)不斷優(yōu)化,以降低毒性并提高效率。第一代CAR-T細胞結(jié)構(gòu)最簡單,僅包含外部結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域以及CD3ζ作為細胞內(nèi)信號傳導區(qū)。第二代CAR-T細胞在細胞內(nèi)信號傳導區(qū)增加了共刺激結(jié)構(gòu)域(如CD28或4-1BB),以增強T細胞多次暴露于抗原后的增殖能力。第三代CAR-T細胞同時包含CD28和4-1BB兩種共刺激結(jié)構(gòu)域。第四代CAR-T細胞也稱為“T細胞重定向用于通用細胞因子殺傷(TRUCK)”,其特點是增加了細胞因子(如IL-12)的表達模塊。這些細胞因子由CAR-T細胞釋放,用于調(diào)節(jié)T細胞反應、增強NK細胞的激活,并將巨噬細胞極化為對抗腫瘤細胞的M1表型。除了IL-12,IL-2、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-23和IL-27等細胞因子也在研究中。第五代CAR-T細胞結(jié)構(gòu)中包含截短的細胞質(zhì)IL-2受體β鏈結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域能夠與轉(zhuǎn)錄因子信號轉(zhuǎn)導和激活轉(zhuǎn)錄因子3(STAT3)結(jié)合。當T細胞與抗原結(jié)合時,會同時激活TCR(通過CD3ζ結(jié)構(gòu)域)、共刺激結(jié)構(gòu)域(CD28結(jié)構(gòu)域)以及細胞因子JAK-STAT3/5信號通路。IL-2受體β鏈結(jié)構(gòu)域和JAK-STAT通路可促進細胞增殖,防止細胞終末分化。

 

CAR-T細胞療法在治療B細胞急性淋巴細胞白血病(B-ALL)和彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)患者中取得了前所未有的高完全緩解(CR)率。截至目前,F(xiàn)DA已經(jīng)批準了7款基于CAR-T細胞的療法,相關(guān)信息總結(jié)如下表。

CAR-T細胞治療藥物的生產(chǎn)制備和表征

 

CAR-T細胞療法的有效性無可爭議,但這種治療方法也有其局限性。只有少數(shù)接受治療的患者實現(xiàn)了CR。同時,許多患者遭受了嚴重的毒性,包括細胞因子釋放綜合征(CRS)、免疫效應細胞相關(guān)神經(jīng)毒性綜合征(ICANS),甚至在某些情況下導致死亡。此外,相當數(shù)量的患者(高達66%)在治療后出現(xiàn)復發(fā)。

 

CAR-T細胞療法的成功與否在很大程度上受到生產(chǎn)過程的影響。每一個步驟都面臨挑戰(zhàn),并且可以進一步改進。比如自體或異體T細胞的收集,以及它們在輸注前的耗竭狀態(tài),對CAR-T細胞療法的療效有重大影響。另外,體外過度刺激T細胞會導致其早期耗竭,而轉(zhuǎn)染方法可能導致T淋巴細胞的惡性轉(zhuǎn)化。本文總結(jié)了體外CAR-T細胞的純化、擴增和表征方法。

 

起始物料選擇

自體和異體移植

 

CAR-T細胞制造的初始步驟是選擇和收集起始材料。在自體CAR-T細胞療法中,T細胞是從患者體內(nèi)提取的,并在經(jīng)過實驗室改造后重新輸注回同一位患者體內(nèi)。而在異體移植(通常稱為“現(xiàn)貨型/健康供體”)中,T淋巴細胞來源于健康供體,并被輸注給癌癥患者。這兩種程序各有優(yōu)缺點。

 

自體移植的優(yōu)點是沒有移植物抗宿主病(GvHD)的風險,并且與異體移植相比,細胞在體內(nèi)的持久性更長。然而,自體T細胞療法也面臨諸多挑戰(zhàn),包括復雜的生產(chǎn)過程、高成本、T細胞的變異性、由于先前腫瘤治療導致的T細胞耗竭和功能障礙等。CAR-T細胞的療效在很大程度上取決于純化T淋巴細胞的特性,而這些特性可能受到患者年齡、癌癥類型、既往治療以及T細胞被癌細胞污染風險等因素的影響。為解決自體CAR-T細胞移植的挑戰(zhàn),異體CAR-T細胞療法被作為一種潛在解決方案。異體療法提供了一種均質(zhì)化、標準化且易于獲取的選項,成本較低,且有可能實現(xiàn)多次給藥。更重要的是,異體CAR-T細胞療法可能特別適合用于侵襲性腫瘤,因為它消除了產(chǎn)品被惡性T細胞污染的風險。然而,異體移植的局限性包括GvHD的風險以及宿主介導的免疫排斥反應,即受者的免疫細胞攻擊輸注的CAR-T細胞,從而削弱其療效。

 

為緩解這些問題,已開發(fā)出多種策略。例如,可通過使用抗CD52抗體(如阿侖單抗)來消除宿主的CD52+異體反應性T細胞,這些細胞負責耗竭注入的CAR-T細胞。為此,必須在輸注前通過基因編輯破壞CAR-T細胞內(nèi)源性CD52的表達?;蚓庉嬤€可以靶向TCR和人類白細胞抗原(HLA),以進一步降低異體反應性。另一種策略是采集具有不同亞群的T淋巴細胞,例如攜帶γδTCR的T細胞,因為它們的細胞毒性比傳統(tǒng)用于CAR-T細胞產(chǎn)品的αβTCR更強。最后,重新輸注分化程度較低的細胞群體,如多能干細胞、前體T細胞或臍帶血細胞,可能會降低GvHD的風險。

 

T細胞富集方法

 

CAR-T細胞療法的起始材料是患者或供體的外周血單個核細胞(PBMCs)。PBMCs由70%-90%的淋巴細胞組成(其中包括70%-85%的CD3+T細胞、5%-10%的B細胞和5%-20%的NK細胞),單核細胞占10%-20%,樹突狀細胞(DCs)占1%-2%。PBMCs通過白細胞分離術(shù)或密度梯度離心從全血中分離出來,然后清洗以去除抗凝劑、紅細胞和血小板等雜質(zhì)。去除血小板至關(guān)重要,因為血小板可以與免疫細胞聚集,并表達可能被熒光抗體標記的Fc受體,從而在流式細胞術(shù)中導致假陽性結(jié)果。

 

CAR-T細胞生產(chǎn)的第二步是通過選擇性富集T細胞群體。當然,這一步是可選項。通常利用帶有抗體的磁珠進行陰選和陽選。比如,使用抗CD4/CD8或抗CD3抗體偶聯(lián)珠子。FDA批準的其中6種CAR-T中,3種采用的陽選。具體而言,Brexu-cel和Liso-cel是通過抗CD4/CD8抗體偶聯(lián)珠子進行陽選得到的,而Tisa-cel則是通過抗CD3/CD28抗體偶聯(lián)珠子進行陽選得到的。陽選需要注意的是,當細胞表面的受體被抗體結(jié)合時,細胞可能會接收到信號,從而改變其行為。比如,CD8和CD4的結(jié)合可以通過增加炎癥細胞因子的釋放和增強毒性,影響T細胞生物學,與CD3/CD28富集相比更為顯著。此外,CD3/CD28選擇還可以富集γδT細胞,而這些細胞由于表面缺乏CD4/CD8標記,會被CD4/CD8選擇排除。γδT細胞的重要性在于其與良好預后密切相關(guān),并具有天然的抗腫瘤功能。

 

陰性選擇是富集T淋巴細胞的有效替代方法,與通過CD4/CD8陽性選擇獲得的CAR-T細胞相比,陰性選擇得到的CAR-T細胞在擴增、轉(zhuǎn)導效率和表型方面相似。該過程使用抗CD14、抗CD15、抗CD16、抗CD19和抗CD56抗體偶聯(lián)珠子的混合物,從PBMCs中去除單核細胞/巨噬細胞、粒細胞、NK細胞和B細胞,而T淋巴細胞則未受影響。陰性選擇已在臨床(如Cilta-cel)和臨床前研究中被使用。

 

由于T細胞是PBMCs的主要成分,許多團隊選擇直接刺激它們,而無需專門富集T細胞群體。這種方法的可行性也得到了FDA批準的CAR-T細胞產(chǎn)品(如Axi-cel和Ide-cel)的支持。下圖展示了FDA批準的其中6款CAR-T產(chǎn)品的體外富集方法。

CAR-T細胞治療藥物的生產(chǎn)制備和表征

 

體外T細胞激活和分化

 

T細胞激活

 

CAR-T細胞的生產(chǎn)通常包括三個步驟:激活、轉(zhuǎn)染和體外擴增,至少需要6天。在自然狀態(tài)下,CD8?和CD4?T細胞在與結(jié)合到MHCⅠ類或MHCⅡ類分子上的靶抗原相互作用后,會激活、增殖并分化為各種短壽命的效應亞群。在體外,可以通過使用游離的或包被在磁珠上的抗CD3/CD28抗體來實現(xiàn)T細胞的激活,其中后者是體外T細胞激活最常用的方法,占CAR-T細胞產(chǎn)品的66%。在6種FDA批準的CAR-T細胞產(chǎn)品中,有3種使用抗CD3/CD28抗體進行T細胞激活,分別是Brexu-cel、Axi-cel和Ide-cel。常見的磁珠與細胞(B:C)比例為3:1。

 

當T淋巴細胞通過與其對應抗原結(jié)合而被激活時,它們會上調(diào)并表達如CD25和CD69等表面標志物。CD25被認為是晚期激活的通用標志物,它是IL-2受體的一部分,在激活的淋巴細胞和調(diào)節(jié)性T細胞上高表達,其表達量與激活程度相關(guān)。而CD69在TCR/CD3結(jié)合后迅速誘導,被認為是早期激活標志物,在激活后30-60分鐘可檢測到,4-6小時后水平下降。

 

T細胞分化

 

細胞因子對CAR-T細胞的質(zhì)量和功能至關(guān)重要。IL-2、IL-7和IL-15影響T細胞的組成、質(zhì)量和表型,顯著影響CAR-T細胞療法的體內(nèi)療效。它們還可以在體外誘導T細胞增殖。IL-2已廣泛用于CAR-T細胞生產(chǎn)的制造方案中,包括FDA批準的療法,如Brexu-cel和Axi-cel(300U/mL)。其中,300U/mL和100U/mL是最常用的T細胞激活濃度,而較低的濃度如20U/mL、40U/mL、50U/mL和200U/mL也被使用。

 

盡管IL-2被廣泛使用,但它可能導致一種相對成熟的表型(CD62LlowCCR7+CD27+CD28+),這種表型更有利于調(diào)節(jié)性T細胞的擴增,而不是記憶T細胞。因此,選擇富含記憶細胞的群體,特別是記憶T干細胞(TSCM)至關(guān)重要。這些細胞在體內(nèi)表現(xiàn)出更好的持久性、定植能力和療效,與分化程度更高的表型(如效應T淋巴細胞)相比具有優(yōu)勢。TSCM的增強療效主要歸因于它們能夠像干細胞一樣進行多次細胞分裂,迅速生成高度增殖、自我更新、多能的后代細胞,這些細胞能夠快速對抗原產(chǎn)生響應。T細胞的增殖和存活與抗腫瘤療效和體內(nèi)持久性相關(guān),故富集TSCM和中央記憶T細胞(TCM)是CAR-T細胞療法的研究重點??梢酝ㄟ^在移植前限制T細胞的體外增殖以及刺激IL-7和IL-15受體來實現(xiàn),這些受體可以減輕T細胞的終末分化,并增加記憶干細胞的比例。與用IL-2刺激的T細胞相比,用IL-7和IL-15刺激的T細胞表現(xiàn)出更低的耗竭標志物表達、更高的促炎細胞因子分泌以及更強的抗腫瘤效果。然而,這個方向目前還有一些爭議,促進TSCM富集的最佳細胞因子組合尚未明確。目前對于使用IL-7和IL-15也未沒有共識;一些團隊甚至報告說IL-2刺激可以誘導TSCM表型。此外,通過IL-7和IL-15刺激獲得的TSCM比例差異很大,范圍從10%-30%到60%-70%,這可能會影響CAR-T細胞的療效。

 

活化的T細胞轉(zhuǎn)染

 

病毒法轉(zhuǎn)染

 

病毒已經(jīng)成為CAR-T細胞基因改造的標準臨床方法。這種方法可以確保遺傳物質(zhì)整合到宿主細胞基因組中,實現(xiàn)高轉(zhuǎn)染率和轉(zhuǎn)基因的長期穩(wěn)定表達。病毒載體主要有兩大類:γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒。γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒只能轉(zhuǎn)導分裂細胞,因此需要激活細胞,而慢病毒可以轉(zhuǎn)導分裂和靜止細胞。

CAR-T細胞治療藥物的生產(chǎn)制備和表征

 

在FDA批準的其中6種CAR-T細胞產(chǎn)品中,33%(Axi-cel和Brexu-cel)使用了γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒,而67%是基于慢病毒介導的轉(zhuǎn)導。

CAR-T細胞治療藥物的生產(chǎn)制備和表征

 

目前,沒有確鑿證據(jù)表明哪種病毒載體更好。病毒載體的一個主要問題是潛在的癌基因插入風險。然而,在臨床中尚未觀察到相關(guān)病例。此外,通過瞬時轉(zhuǎn)染生產(chǎn)慢病毒需要大量DNA,這會增加生產(chǎn)成本。慢病毒傾向于整合到轉(zhuǎn)錄活躍基因的內(nèi)含子中,從而降低了癌基因插入的風險。相比之下,γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒更傾向于整合到轉(zhuǎn)錄起始位點、增強子和啟動子附近。

 

非病毒法轉(zhuǎn)染

 

穩(wěn)定基因轉(zhuǎn)移可以通過多種非病毒方法實現(xiàn),包括轉(zhuǎn)座子、CRISPR/Cas9、mcDNA載體和納米顆粒(NPs)。

 

轉(zhuǎn)座子是能夠通過“剪切-粘貼”機制在基因組內(nèi)改變位置的DNA序列。這一過程依賴于轉(zhuǎn)座子和轉(zhuǎn)座酶。轉(zhuǎn)座子攜帶目標基因,其兩側(cè)有反向末端重復序列,這些序列可被轉(zhuǎn)座酶結(jié)合。轉(zhuǎn)座子的優(yōu)點包括生產(chǎn)成本低、無需臨床級載體、能夠高效且永久地插入基因組,且比病毒方法更安全。此外,轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)染可以在激活的和靜止的原代T細胞中進行。在最新一代的CAR-T細胞中,同時轉(zhuǎn)移多個基因至關(guān)重要,而轉(zhuǎn)座子特別適合這一目的,因為它們可以攜帶比病毒更大的遺傳物質(zhì)。然而,轉(zhuǎn)座子也有一些缺點,與病毒方法相比,生成CAR-T細胞所需時間更長,轉(zhuǎn)染效率較低。兩種最常用的轉(zhuǎn)座子/轉(zhuǎn)座酶系統(tǒng)——SleepingBeauty(SB)和piggy-Bac——分別可實現(xiàn)25%-80%和20%-40%的T細胞轉(zhuǎn)染效率。

 

CRISPR/Cas9技術(shù)是轉(zhuǎn)座子的有前景的替代方法,可實現(xiàn)約20%-60%的CAR+細胞比例。該技術(shù)源自細菌和古菌的免疫系統(tǒng),利用與目標DNA序列互補的短RNA片段(導向RNA或gRNA),引導Cas9酶到達這些特定序列。Cas9隨后切割原始DNA,利用細胞的DNA修復機制引入新基因。CRISPR/Cas9是一種簡單、靈活且精確的方法,可在基因組的預定位置整合多個轉(zhuǎn)基因。該技術(shù)當前的挑戰(zhàn)包括優(yōu)化和標準化基因編輯過程以提高穩(wěn)定性和效率,以及減少或消除最近發(fā)現(xiàn)的基因組編輯的后果——染色體丟失。

 

另一種有效的非病毒機制是使用CARmcDNA載體結(jié)合電穿孔將CAR結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)染到T細胞中。這些mcDNA載體源自含有CAR序列的超螺旋親本DNA載體。在轉(zhuǎn)化到ZYCY10P3S2T大腸桿菌后,親本載體發(fā)生重組,產(chǎn)生兩個產(chǎn)物:CARmcDNA載體和一個包含細菌來源和抗生素基因的質(zhì)粒骨架。后者在培養(yǎng)基中加入L-阿拉伯糖后被I-SceI內(nèi)切酶降解。mcDNA載體的優(yōu)點包括由于缺乏殘留細菌成分而無免疫反應,且在細胞內(nèi)持久存在。通過mcDNA轉(zhuǎn)染可實現(xiàn)超過50%的轉(zhuǎn)染效率,超過慢病毒方法。然而,從質(zhì)粒中去除細菌成分可能復雜,且常導致產(chǎn)量低和細菌基因組DNA污染。

 

2017年,史密斯等人發(fā)表了一篇有趣的文章,展示了載有CAR編碼質(zhì)粒的聚合物納米顆粒在體內(nèi)誘導T淋巴細胞表達CAR的效率,其特異性由抗CD3抗體介導的納米結(jié)構(gòu)實現(xiàn)。此后,還出現(xiàn)許多其他平臺,包括脂質(zhì)納米顆粒、納米管和各種聚合物納米結(jié)構(gòu)。然而,納米顆粒并非沒有局限性。擴大生產(chǎn)工藝可能復雜,且必須認真考慮納米顆粒的潛在毒性。

 

CAR-T細胞的細胞毒性

 

評估CAR-T細胞體外殺傷能力的第一步是進行細胞毒性實驗。迄今為止,文獻中已經(jīng)描述了四種主要的實驗方法:鉻(51Cr)釋放實驗、流式細胞術(shù)(通過活/死細胞染色)、熒光素酶活性檢測以及細胞脫落(阻抗法)。每種方法都有其自身的優(yōu)缺點。

 

效應細胞與靶細胞(E:T)的比例是影響CAR-T細胞體外療效的最關(guān)鍵參數(shù)。文獻中已經(jīng)測試了多種E:T比例,例如1:1、3:1、5:1、10:1和20:1。這些研究評估了體外癌細胞的殺傷百分比以及細胞因子的釋放。由于抗原的差異、實體瘤與血液瘤的性質(zhì)不同以及CAR生成的具體情況,目前尚未就每種CAR-T細胞和癌細胞組合的最佳條件達成共識。通常,設(shè)置的E:T比例可導致血液和實體腫瘤細胞的殺傷率在40%到95%之間。

 

除了細胞毒性外,細胞因子定量是確定CAR-T細胞體外功能的最重要指標之一??梢圆捎肊LISA檢測。最常被定量的細胞因子包括INF-γ、IL-2和TNF-α,以及GM-CSF和顆粒酶B。酶聯(lián)免疫斑點試驗(ELISpot)、流式細胞術(shù)和細胞內(nèi)染色(ICS)等方法也可以考慮。

 

引自:CAR-T Cell Manufacturing for Hematological and Solid Tumors: From the Preclinical to Clinical Point of View

 

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來源:藥理毒理開發(fā)

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