1 實(shí)驗(yàn)原理
雙熒光素酶基因報(bào)告系統(tǒng)(Dual Luciferase Reporter Assay System)是一種常用于評估基因調(diào)控元件(如啟動(dòng)子、增強(qiáng)子或microRNA靶點(diǎn))活性的實(shí)驗(yàn)方法。該系統(tǒng)通常涉及兩個(gè)質(zhì)粒的共轉(zhuǎn)染,其目的是為了提供更準(zhǔn)確和可靠的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。這兩個(gè)質(zhì)粒及其作用如下:
1. 報(bào)告質(zhì)粒(Reporter Vector):
這個(gè)質(zhì)粒包含了待研究的調(diào)控序列上游的螢火蟲熒光素酶(Firefly luciferase, Fluc)基因。這個(gè)調(diào)控序列可以是啟動(dòng)子、增強(qiáng)子或其他順式作用元件。
當(dāng)細(xì)胞被轉(zhuǎn)染后,如果調(diào)控序列活躍,則會(huì)驅(qū)動(dòng)螢火蟲熒光素酶基因的表達(dá)。通過測量螢火蟲熒光素酶的活性,我們可以間接了解目標(biāo)調(diào)控序列的功能或活性水平。
2. 內(nèi)參質(zhì)粒(Control Vector):
內(nèi)參質(zhì)粒通常攜帶海腎熒光素酶(Renilla luciferase, Rluc)基因,作為內(nèi)部對照使用。它不受實(shí)驗(yàn)處理的影響,并且在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中保持恒定表達(dá)。
海腎熒光素酶的作用是標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)結(jié)果,以校正由于細(xì)胞數(shù)量差異、轉(zhuǎn)染效率變化或其它實(shí)驗(yàn)條件波動(dòng)帶來的影響。通過比較兩種熒光素酶的相對活性,可以獲得更加可靠的數(shù)據(jù)。
通過同時(shí)轉(zhuǎn)染這兩個(gè)質(zhì)粒并檢測兩種不同類型的熒光素酶活性,研究人員可以得到關(guān)于特定調(diào)控序列功能的信息,同時(shí)確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的穩(wěn)定性和可重復(fù)性。這種方法廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究中,尤其是在探索基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制時(shí)。
2 實(shí)驗(yàn)流程
3 實(shí)驗(yàn)步驟
1、報(bào)告基因質(zhì)粒構(gòu)建:將目的片段插入到熒光素酶表達(dá)的報(bào)告基因載體上,如pGL3-basic、Psicheck-2等常見載體。通常是把目的基因結(jié)合區(qū)域或者基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控元件克隆在螢火蟲熒光素酶基因的上游,構(gòu)建成熒光素酶報(bào)告質(zhì)粒。
2、細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染:選擇合適的細(xì)胞系,如常用的工具細(xì)胞HEK293T等,用含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,在37°C、5%CO?的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待細(xì)胞密度達(dá)到70%~80%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染。
3、共轉(zhuǎn)染:將構(gòu)建好的報(bào)告基因質(zhì)粒和帶有海腎熒光素酶基因的內(nèi)參質(zhì)粒,按照一定比例使用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染法等方法共同轉(zhuǎn)染入細(xì)胞。
以miRNA靶基因驗(yàn)證為例 :
4、細(xì)胞裂解:轉(zhuǎn)染后48h左右,去除培養(yǎng)基,用PBS清洗細(xì)胞1~2次,加入細(xì)胞裂解液,室溫裂解細(xì)胞15~30min左右,以保證細(xì)胞充分裂解。
5、熒光素酶活性測定:初次使用時(shí),需配制Firefly Luciferase(螢火蟲熒光素酶)的底物,將其溶解在LARII buffer(Buffer 1)中,并分裝-80℃避光保存;同時(shí)現(xiàn)用現(xiàn)配Stop & Glo(Buffer 2),即Renilla Luciferase(海參熒光素酶)的底物,用于終止LARII buffer(Buffer 1)的反應(yīng)。
6、檢測讀數(shù):向一定量(如40μl)的LARII中加入適量(如10μl)細(xì)胞裂解液,吹打混勻后,立即用酶標(biāo)儀檢測讀數(shù),即為Firefly luciferase的值;接著加入等量的Stop & Glo,再次讀數(shù),即為Renilla Luciferase的值。
7、數(shù)據(jù)處理與分析:計(jì)算每管的Firefly Luciferase/Renilla Luciferase的比值,再以control組的比值為單位,得到不同處理組的相對luciferase活性,以此來反映該處理組基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控活性。通常采用t檢驗(yàn)或方差分析等統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,比較各樣品間相對熒光值的差異,判斷目的基因?qū)晒馑孛富钚缘挠绊懯欠耧@著。
8、結(jié)果分析和解讀:
(1)相對熒光素酶活性(Relative Luciferase Activity,RLA)的計(jì)算方法,即RLA=螢火蟲熒光素酶活性值(Fluc值)/海腎熒光素酶活性值(Rluc值)。以miRNA靶基因驗(yàn)證為例 :計(jì)算步驟步驟如下:
1.先計(jì)算出每孔的Firefly Luciferase/ Renilla Luciferase的比值(F/R);
2.求出miRNA-Ctrl三個(gè)重復(fù)孔的平均值(average1)
3.再以miRNA-Ctrl組的average1為標(biāo)準(zhǔn)1進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,即用miRNA mimic組的F/R三個(gè)重復(fù)值分別除以相對應(yīng)組別average1得到三個(gè)比值
4.上一步中求出的比值的平均值作為average2,并分別用average1和average2的值作柱狀圖
表1 歸一化數(shù)據(jù)處理
(2)以對照組為參照分析相對活性變化
1)雙熒光素酶活性升高:若實(shí)驗(yàn)組的RLA值顯著高于對照組,例如對照組RLA為1,實(shí)驗(yàn)組RLA為3,通常提示所研究的調(diào)控元件對報(bào)告基因(螢火蟲熒光素酶)的轉(zhuǎn)錄具有激活作用,即可能促進(jìn)了目標(biāo)基因的表達(dá)啟動(dòng)或增強(qiáng)了表達(dá)水平。
2)雙熒光素酶活性降低:當(dāng)實(shí)驗(yàn)組的RLA值明顯低于對照組時(shí),比如對照組RLA為1,實(shí)驗(yàn)組RLA為0.5,則表明該調(diào)控元件可能抑制了報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄,使目標(biāo)基因表達(dá)量相對減少。
3)無顯著差異:若實(shí)驗(yàn)組與對照組的RLA值相近,且經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析不存在顯著差異,說明在所設(shè)定的實(shí)驗(yàn)條件下,該調(diào)控元件對目標(biāo)基因轉(zhuǎn)錄可能沒有明顯的調(diào)控作用。
4 注意事項(xiàng)
1、試劑準(zhǔn)備與保存:螢火蟲熒光素酶底物L(fēng)ARII需按需分裝,-80℃避光保存,避免反復(fù)凍融;海腎熒光素酶底物Stop&Glo需現(xiàn)配現(xiàn)用。配好的LARII在-20℃可穩(wěn)定一個(gè)月,在-70℃可穩(wěn)定一年。
2、細(xì)胞轉(zhuǎn)染:注意轉(zhuǎn)染試劑的質(zhì)量和使用說明,不同細(xì)胞系對轉(zhuǎn)染試劑的敏感性可能不同,可進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件,如轉(zhuǎn)染試劑的用量、細(xì)胞密度、轉(zhuǎn)染時(shí)間等。
3、設(shè)立陽性和陰性對照,以確保轉(zhuǎn)染的成功和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。例如,可設(shè)置轉(zhuǎn)染空載體的陰性對照和已知有相互作用的陽性對照組合。
4、實(shí)驗(yàn)操作過程:整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程要注意避光,尤其是在試劑配制、細(xì)胞裂解后以及熒光檢測過程中,防止熒光素酶底物見光分解影響檢測結(jié)果。
5、實(shí)驗(yàn)操作盡量在短時(shí)間內(nèi)完成,一般建議在30min內(nèi),以減少細(xì)胞裂解產(chǎn)物等在室溫下放置時(shí)間過長可能導(dǎo)致的活性變化。
6、樣品和測定試劑混合后到測定前的時(shí)間應(yīng)盡量控制在相同時(shí)間內(nèi),通常1~2s,以保證檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性和可比性。
7、結(jié)果分析與問題排查:如果測量的熒光值較低,首先排除轉(zhuǎn)染效率問題,可通過在12孔板多鋪一孔細(xì)胞轉(zhuǎn)染熒光質(zhì)粒,觀察轉(zhuǎn)染的熒光效率;若排除轉(zhuǎn)染問題后熒光讀值仍然較低,可以嘗試增加轉(zhuǎn)染質(zhì)粒量。
8、若測量的熒光值過高,則可減少轉(zhuǎn)染質(zhì)粒量,或者適當(dāng)稀釋細(xì)胞裂解離心后的上清液。
9、若背景過高可能影響結(jié)果的準(zhǔn)確性,需檢查試劑是否被污染、細(xì)胞是否有自發(fā)熒光等問題,并采取相應(yīng)的解決措施。
資料:https://images.app.goo.gl/FPT4rHBZRit5etqJ7
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