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食品微生物檢測是指運(yùn)用微生物學(xué)的理論與方法按照嚴(yán)格的檢測流程和科學(xué)的檢測方法對(duì)被檢食品中微生物的種類、數(shù)量、性質(zhì)等作出判定以判別被檢食品是否符合食用標(biāo)準(zhǔn)的科學(xué)依據(jù)。食品微生物檢測是食品安全檢測細(xì)分的一個(gè)類目，是食品安全的重要組成部份。食品微生物檢測是衡量食品衛(wèi)生質(zhì)量的重要指標(biāo)。通過對(duì)食品進(jìn)行微生物檢測可以判斷食品加工環(huán)境及食品衛(wèi)生情況為各項(xiàng)衛(wèi)生管理工作提供科學(xué)依據(jù)，從而保障人民的身體健康

近期，出現(xiàn)的三全水餃“病菌門”和蒙牛雪糕微生物超標(biāo)現(xiàn)象，引起了社會(huì)的廣泛關(guān)注。微生物檢測實(shí)屬食品檢測的重要項(xiàng)目，餐飲業(yè)、加工食品的微生物指標(biāo)都需要達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)，否則將危害人類健康。國內(nèi)外開展微生物的檢測項(xiàng)目的食品種類繁多，我國開展食品微生物檢測的重點(diǎn)食品種類為：奶制品、罐頭食品、調(diào)味品、蛋制品、淀粉類制品、發(fā)酵和非發(fā)酵性豆制品、冷冰飲品、糖果、飲用天然礦泉水等，其中食糖以及保健品的微生物檢驗(yàn)為我國所獨(dú)有。

目前，我們國家對(duì)于食品微物檢測主要指有菌落總數(shù)、大腸菌群和致病菌三項(xiàng)。我們國家對(duì)于食品微生物檢測從采集樣本到出具檢測報(bào)告有規(guī)范的操作流程。食品微物檢測需要經(jīng)過樣品采集-樣品送檢-樣品處理-樣品檢驗(yàn)-結(jié)果報(bào)告五個(gè)流程。對(duì)于食品微物檢測方法，不同的檢測項(xiàng)目對(duì)應(yīng)有不同的檢測方法，目前主要有普通培養(yǎng)法（簡稱國標(biāo)方法）一般出報(bào)告的要用，儀器法、核酸檢測法（PCR）、還有目前的快速檢測法（主要包括：免疫磁珠、酶聯(lián)免疫試劑盒、金標(biāo)檢測卡等。